芽变育种是果树培育新品种的常用方法之一。芽变是体细胞突变的一种形式，发生于植物体芽的分生组织细胞中，是指芽萌生为枝条或由此长成的个体的性状上表现出与原类型不同的现象。一般以枝条变异的形式出现。芽变育种就是利用发生变异的枝条、芽进行无性繁殖，使该性状固定，再通过比较鉴定，培育新品种的选择育种法。但并不是所有的枝条、芽性状改变都是芽变，可通过对芽变植株遗传物质鉴定的方法来辨别。目前，已利用芽变育种的方式选育了很多优良品种。笔者介绍几个常见果树树种近年来利用芽变选育的新品种。
3 柑橘芽变选育品种
柑橘与其他果树不同的是，大多数品种具有多胚性，再加上消费者对无籽性状的追求，如今多数栽培品种存在不同程度的性器官败育。这就导致柑橘品种选育中，芽变选种这一途径占有很大比重。
3.1 桂橘一号
桂橘一号（图6）是从蜜广橘芽变中选育的早熟柑橘新品种。由广西特色作物研究院·广西柑橘生物学重点实验室、华中农业大学、兴安县农业局和兴安县科技局共同选育。审定号：桂审果2014002 号。果实扁圆形，果皮橙黄色，果面光滑，有光泽，果肉橙黄色，化渣，味清甜；平均单果质量46.77 克，最大单果质量63.3 克，果形指数0.72；每果实含种子0.85 粒，单胚，子叶淡绿色。可食率78.01% ，果汁率61.31% ，可溶性固形物含量12.29%，全糖含量11.02%，可滴定酸含量0.64%，固酸比19.85，维生素C 含量0.212 毫克/克；品质上等。果实生育期160 天，第3 年结果，丰产性好。桂北地区及柳州都能栽培，适宜南丰蜜橘种植的区域。在广西兴安县观察：春梢抽发期3 月中下旬至4 月中下旬，夏梢期为5月中下旬至6 月中下旬，秋梢期8 月中旬左右；花蕾期4月中旬，初花期4 月中下旬，盛花期4 月下旬，果实成熟期10 月上中旬至11 月上中旬。
3.2 粤丰早橘
粤丰早橘（图7）是从‘南丰蜜橘’芽变中选育出来的优良新品种，由广东省农业科学院果树研究所·农业部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室、始兴县顿岗农业技术咨询服务站和始兴县鑫源水果专业合作社选育，2014 年1 月通过广东省农作物品种审定委员会审定。果实扁圆形；果皮光滑，橙黄色，果面无沟纹；油胞密集，中等大小；果皮厚1.8 毫米。果顶稍凹，印圈较明显。单一品种种植时单果种子数为0.3 粒，与有籽柑橘品种混栽时种子数增加。平均单果质量58.33 克。果肉橙红、较化渣；可溶性固形物含量13.36%，总糖含量11.80%，总酸含量0.52%，维生素C 含量0.208 毫克/克。生长势强，树姿较直立。主干茎灰绿色。叶长卵形，深绿色，平均叶长7.4 厘米，叶宽3.3 厘米，叶面有光泽。花序单生或丛生，花白色，花瓣5 枚，舌状，花瓣长1.32 厘米，花丝20~22 条，基部联合；花药黄色，花粉多，花柱柱状、柱头扁圆形。以秋、春梢为主要结果母枝。适宜在粤北柑橘产区种植。在广东韶关地区，3 月中旬萌发春梢，7 月下旬秋梢萌发，结果树基本无冬梢。3 月下旬初花期，10 月上中旬果实成熟。